當時萬曆正在坤甯宮和王皇後商量如何處置梃擊案的審訊結果。王皇後被萬曆冷落了多年，一心效法李太後，對朱常洛多關心。今日突然見萬曆來到，連忙上前迎接問道：“今天是什麼風把皇上吹來見臣妾？”萬曆把梃擊案的來龍去脈詳詳細細告知王皇後。王皇後猜到萬曆此行為何，便道：“此事臣妾亦做不了主，必須當着太子殿下講明。”萬曆一聽，甚為難堪，一邊是自己的愛妾，一邊是皇儲太子，真的不知道該如何下手判案。忽報太子前來，萬曆心中大驚道：“太子肯定是到過乾清宮知道朕來了坤甯宮才過來的。此時前來，莫非案情太子已知悉？”

通傳後，太子朱常洛進了宮，向萬曆和皇後跪拜請安後，起來便道：“父皇、皇後，兒臣覺得，張差所為，必有主使！”皇帝一聽，橫了跟着太子進來的梁軒一眼，梁軒正要開口說明事實。正在此時，宮人傳話：“鄭貴妃到！”未等萬曆傳見，鄭貴妃闖了進來，頓足戟指指天發誓道：“如果此事真為奴家所為，就讓奴家死一萬次！讓奴家全族受誅！”萬曆一聽，勃然大怒道：“這是皇室大事，你家人的命值幾個錢？你即使全族死光誰會稀罕？”

萬曆為人謙和，朱常洛一輩子很少看見父皇發如此大火，當下還是覺得不如自己息事甯人，當下便改了口風道：“兒臣覺得此時應該就是張差一人所為，就在他身上了結好了。”萬曆深愛鄭貴妃，方才那話一出就已經擔心刺激了愛妃，但自己太子被行刺一事茲事體大，所以處理起來也容易上火，故此氣話沖口而出。本來就後悔萬分、騎虎難下的萬曆聽到太子說出如此體貼的話，就順着台階下來，連忙說道：“哥兒說的是！”（注：明代帝後等長輩稱皇子“哥兒”。）

鄭貴妃見皇帝太子都已寬恕自己，但無論怎麼說，張差都是自己的貼身太監龐保、劉成帶進宮的，心想一來為了讨好皇帝和太子，二來為了給個交代，便道：“臣妾身邊的兩個狗奴才帶人進宮行刺哥兒，萬望陛下處罰。”萬曆點頭道：“着内官監太監韓本用帶人前去緝拿！”梁軒跪禀道：“陛下，此事乃卑職本分，請陛下把此事交予卑職辦理。”

萬曆哼了一聲道：“你也别想摘出去，你到井兒峪去，把馬三道、李守才、孔道三人捉拿歸案！如有一人漏網，殺無赦！”鄭貴妃聽了心中一驚，不過想到保帥就要忍痛棄車，也就不敢作聲了。梁軒聽了更是後腦一涼，他摸了摸脖子道：“陛下，讓卑職一人搗毀幾十人占領的紅封教恐怕力有不逮……況且聽聞總壇井兒峪易守難攻……卑職不是貪生怕死，而是恐怕捉拿不得紅封教妖人，有辱皇命……”