夜晚，毛利偵探事務所。

柯南在台燈的燈光下翻閱着什麼資料，鏡頭拉進，他看的是報紙，内容是“國中一年級的學生紫砂，原因是在校被欺負，欺負人的是同班A同學……”

一邊看報紙，柯南一邊想着，“John是隻訓練有素的狗，應該不會無緣無故攻擊人啊……等一下，John是在聽了電話之後才開始攻擊被害者……對了！難道是坂口先生在電話裡面給它指令？”

想到這裡，柯南響起了坂口先生平常笑眯眯的樣子，仍有疑問，“坂口先生人那麼好，為什麼會……”

轉眼天亮了，目暮警官一早就來到了毛利偵探事務所内，柯南沒等目暮警官喝完一杯水就着急的問John的下落，目暮警官表示，John被帶到了警察局裡面，它畢竟還沒有被判刑，讓柯南放心。柯南聽完這番話明顯松了一口氣。

毛利小五郎看目暮警官喝完了水，也回答了柯南的問題，于是他也問目暮警官坂口先生怎麼說。

目暮警官說，坂口先生也不相信John會随随便便的去攻擊人，随即柯南就知道了John即将被“處理”……

柯南通過聊天在坂口先生的言行中發現了端倪，于是提醒毛利小五郎做了第一次實驗，經典教育學實驗“巴布洛夫的狗”實驗開始了，無線電話中傳來的鈴聲加上坂口先生的問候，這一次，John沒有撲上去要人。

小蘭為了John擔心不已，晚上還在窗邊，認為這時候隻有新一能救John了……

就在John要被送去藥物處理的當天，柯南在跟帝丹小學三人組一起上遊泳課的時候，被老師吹的哨聲提醒，終于知道第一次實驗缺少了什麼。

第二次實驗開始了。

第一步，定位，無線電電話鈴聲想起，接線員接通電話并說出：“你好，請問那位？”

第二步，預備，時鐘響起準點的鈴聲。噔~噔~噔~

第三部，坂口先生通過無線電話說出指令。這倆坂口先生還沒說出指令就認罪了……還詳細說明了犯罪原因：小剛先生，也就是前園剛，是将坂口先生的兒子正人校園霸淩到去世的罪魁禍首！坂口先生專為青少年處理犯罪案件，本來就心地善良的他，看到小剛先生跪在正人的靈堂上忏悔痛苦的模樣，以為小剛先生收到良心的譴責，會重新做人，于是心軟原諒了小剛先生。

跟着父母到外地讀書的小剛先生考回了東京的學校，還租到了坂口家旁邊的房子。一天，把John帶出去玩的坂口先生看到小剛先生正在氣氛一個男生，勒索錢物，他才明白小剛先生已經忘了正人，忘了以前的事情，也忘了他這個正人的父親……

坂口先生明白了，小剛先生是完全不記得，自己逼死過一個人的事情，才會租房搬到坂口先生家附近。看到了小剛的無藥可救，以及死不悔改，明白了以前的小剛是在惺惺作态，遂決定自己動手訓練John報仇雪恨。

不得不說這裡的犯罪動機是很說的過去的，就是日本關注校園霸淩的時間這麼早的嗎？小剛先生的行為是要受到懲罰，但這懲罰不應該由私人執行，這個道理他應該頗有名氣的大律師不懂嗎？看來還是仇恨太深以至于打破了坂口先生應有的底線。“如果法律不能制裁他，那就用正義制裁他！”話說的很好，就是不太合适……