由于朝廷加強了沿海地區的防務，孫恩大軍在海島無法獲得給養，再加上禍不單行，軍中又爆發疫病，死者大半。

到了元興元年（402）三月，孫恩終于承擔不住内部壓力，又發兵進攻臨海。這次，孫恩軍并未掀起什麼大的波浪，不久傳來消息，臨海太守辛景大勝而歸，孫恩及其部分家屬，再加上部下總共百餘人，一起投海而死。

當然，這時孫恩的死已經不能激起什麼波瀾了，因為建康的東晉朝廷遇到了前所未有的危機。

孫恩叛亂之前的三吳之地，雖然百姓廣受剝削，但因承平日久，相較其他地方已是十分富裕。

然而孫恩之亂中，浙東百姓所遭受的不僅有孫恩軍的燒殺搶掠，還有來自于朝廷的傷害。因為朝廷所派的大軍除了鎮壓之外，也大多趁機在此大肆掠奪屠殺，導緻民怨四起。

孫恩之亂持續了多年，三吳之地早已被搞得殘破不堪，死者甚衆。百姓既然憂心身家性命和不多的财産，自是無心也無力好好耕種。

而現在，老天又來湊了個熱鬧，氣候持續幹旱，這毒瘡終于被戳破，爆發了大規模的饑荒。

此時的東晉朝廷所能控制的區域，實質上隻有所謂“東土”的三吳地區，其餘都不過是名義上的臣服，再加上荊州都督桓玄又有不臣之心，此時更是抓住機會落井下石，封鎖了長江，不讓物資向下遊運輸。

朝廷眼看着自己都要吃不上糧了，終于不得不睜眼看到這不斷積累的痛苦，而到了這個時候，饑荒與疫病，則早在這片土地上無情地肆虐了很久。

王瑾之本以為，朝廷這下總該是要派人籌措糧食，赈濟災民了。

誰知朝廷商讨許久，竟是想出了攻打桓玄的好主意。當然，桓玄壓着糧食不放，吓唬吓唬，讓他們放糧也不算錯。

可惜此時的皇帝晉安帝司馬德宗是出了名的傻子，甚至民間都有耳聞，如今朝政是被年少的司馬元顯把持的。

這司馬元顯或許是真的過分年輕了，雖然聰慧，卻也将事情想得簡單了，對人心的把握也欠缺了些，後面神奇的事情進展也說明了這一點。

說起來也有趣，還在陳家村時，王瑾之等人私下裡談笑，陳嚴還曾感慨，宗室、高門果然與我們不同，明明是差不多年紀，我等還在為如何建功煩惱，對方已經權勢滔天了。

元興元年（402）正月，司馬元顯先是大赦，改年号為元興，之後便公開桓玄的罪狀，下令征讨荊州。

他親自擔任骠騎大将軍、征讨大都督，以劉牢之為前鋒都督，谯王司馬尚之為後軍統帥。

剛剛說了，司馬元顯是在正月下令征讨，但直到二月，他還在建康。

這期間，桓玄倒是發來了檄書控訴司馬元顯的罪狀，接着竟是後發制人地先起兵來攻打建康了。

這樣一來，司馬元顯再抵擋不住朝廷上下的催促，不得不出發了。

但戲劇性的是，晉安帝置酒餞行後，他上船沒多久竟然又偷偷從船上逃回了家，于是軍隊始終沒能出發。

這發展讓王瑾之瞠目結舌，真是見了鬼了，别說司馬元顯是這一人之下萬人之上的身份了，就是個小領導做項目，在這火燒眉毛的時候了，也不會臨陣脫逃啊！

這軍隊遲遲不出發，桓玄的軍隊倒是一路殺來了，該怎麼辦呢？舉朝上下商讨很久，終于又想出了個絕妙好主意，那就是派遣齊王司馬柔之拿着驺虞幡到荊州、江州，命令桓玄罷兵。

結果自然是顯而易見的，司馬柔之千裡送人頭，去了就再沒能回來。

再看桓玄這邊，大軍順流而下，一路經過尋陽（今湖北黃梅縣西南）、姑孰（今安徽當塗縣），都是暢通無阻，當然了，大隊兵馬都還在建康那縮着呢，又有誰能來阻攔呢？

一直到了曆陽，此時鎮守曆陽的是豫州刺史谯王司馬尚之，也就是征讨軍的後軍統帥，在這裡，桓玄被攔了一下，但也隻能是一下了，很快，司馬尚之被擒，其弟司馬休之則棄城逃跑。

想到這裡，王瑾之不由歎氣，誰能想到後軍統帥竟然能變成前鋒了呢。

司馬元顯不靠譜，劉牢之也相當不靠譜。怎麼說呢，這段時間，王瑾之他們一直在建康城旁邊的溧州沒動彈，每日就訓練、休息、訓練、休息……

聽說前幾天，劉牢之的一個叫何穆的族舅來訪，那幾天劉牢之的兒子劉敬宣和侄子何無忌總來劉裕帳内說話，來時行色匆匆，去時氣勢洶洶，劉裕的表情也愈發難言。

王瑾之記得，一次路過劉裕營帳時，還隐約聽到劉裕在說什麼将軍糊塗，可惜，聲音很快就被壓低，再聽不清了。

沒過幾天，也就是三月初一，王瑾之就聽說劉牢之派了劉敬宣去桓玄營中。

然後就聽說桓玄軍已經到了建康，之後就接到命令去追擊司馬元顯。